Yahooからの注文が取り込まれない原因は以下が考えられます。

①　「Yahoo!と接続」が上手くいっていない

ストアクリエイターProログインでご利用のYahoo! Japan ID・パスワードで接続されておりますでしょうか。
また、Yahoo!ビジネスマネージャーに連携されているYahoo! Japan IDを変更されておりませんでしょうか。
Yahoo! Japan ID・パスワードの情報を今一度、よくご確認の上で接続をお試しください。
シッピーノからYahoo接続する

②　注文日から30日以上経過している

シッピーノが取込対象とする期間は受注日から30日以内となります。
恐れ入りますが、自社出荷にてご対応をお願いいたします。